转录组测序,一般泛指mRNA(即信使RNA)测序。mRNA占细胞总RNA的2%~5%,种类最多,代谢活跃,是分子生物学中心法则中指导蛋白质合成的直接模板。
对于mRNA测序,利用mRNA在3’端具有poly-A的结构特点,反转录成cDNA建库测序。根据测序得到的mRNA序列,可以精确地比对至参考基因组序列上,从而得出序列信息。对于无参考基因组的物种,通过对序列进行从头拼接(de nove assembly),得到转录本具体的序列信息。通过对不同物种、不同发育阶段的不同组织中的转录组进行研究,可以发现基因转录的物种特异性和时空差异的特点,为深入理解物种和性状的分子机理提供转录组水平的线索。
实验流程:
实验设计——样品取材——Total RNA 抽提——polyA 富集——文库构建——测序——数据分析——实验售后(包括不限于:结果讲解、调整参数重新分析、个性化优化作图)
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