CircRNA测序

CircRNA(circular RNA,即:环状RNA)是一类新型的非编码RNA,由mRNA前体(pre-mRNA)的反向剪接产生 。与传统的线性RNA不同,circRNA具有以共价键形成的闭合环状结构,不存在5’末端帽子和3’末端poly(A)尾巴,不受RNA核酸外切酶影响,表达更稳定且不易降解 ,半衰期更长。circRNA大量存在于真核转录组中,最主要的circRNA类型是外显子来源的,在不同的物种中具有保守性。

circRNA分类:

CircRNA测序实验流程:

• 样品总RNA抽提

• RNA质量检测:使用Nanodrop测定总RNA在分光光度计260nm、280nm和230nm的吸收值,以计算浓度并评估纯度;检测RNA完整性

• RNase R 处理

• cDNA 合成

• cDNA文库测序

• 数据分析及报告整理

部分结果展示:

GO分析:

Kegg 通路图:

ceRNA分析网络图: