CircRNA测序

circRNA(circular RNA,环状RNA)是一种新型的非编码RNA,由mRNA前体(pre-mRNA)的反向剪接产生 。与传统的线性RNA不同,circRNA具有以共价键形成的闭合环状结构,不存在5’末端帽子和3’末端poly(A)尾巴,不受RNA核酸外切酶影响,表达更稳定且不易降解 。

环状 RNA 的表达具有组织和疾病特异性,与组织发育、疾病的发生发展密切相关。此外,环状 RNA 不易降 解,能在血浆、唾液等体液中稳定存在,可以作为新型疾病分子标志物。

为了检测表达的circRNA,使用两种建库方式捕获circRNA:

1、去除核糖体后不加人RNase R,构建的文库包含mRNA、lncRNA、circRNA(RNase-)

2、去除核糖体后再加入RNase R去除线性RNA,仅包含circRNA的circRNA文库(RNase +)

捕获circRNA的两种建库方法